Sì, il problema è proprio lì, perché ifpp non punta a nulla, o meglio punta ad un'area di memoria che non hai allocato. Lo stesso vale per ofpp.
Per risolvere dove dichiari in e out dovresti allocare il puntatore:
Codice:
FILE ** in=(FILE**)malloc(sizeof(FILE*));
FILE ** out=(FILE**)malloc(sizeof(FILE*));
E quando non li usi più dovresti deallocarli con free.
Tra l'altro non ho guardato proprio bene ma mi sembra che un semplice puntatore fosse sufficiente (invece di un doppio puntatore) in questo caso potresti fare:
Codice:
FILE * in;
FILE * out;
e quando richiami la funzione fai:
Codice:
openCommChannels(filein , fileout , &in , &out);