Alcune disto leggere sono recensite su questo sito:
http://livelinux.altervista.org/arti...?lng=it&pg=200
Le più famose sono: puppy e damn small linux (dsl). Se cerchi sul forum troverai *migliaia* di topic come il tuo per farti una cultura a riguardo

Non so dirti quale è la migliore per amule, credo che in un modo o nell'altro sia possibile usarlo su tutte. Il mio consiglio è di provarne più di una.
Si, i file arrivano fino a 2TiB per ext3 e 16 per ext4, ma alcune vecchie distro usano altri fs, come fat32, per essere più compatibili. Comunque dovresti sempre avere la possibilità di adattarle a ext o altri.
Per i file di grandi dimensioni ti suggerisco xfs.