[DevilMalak]

E' da un bel pò che non tocco java e comunque ero un principiante ma dovrebbe funzionare, fa schifetto però può essere una base di partenza

int array[][] = new int[3][3];                   //creazione array bidimensionale 3x3
int i=1;
for (int r=0;r<array.length;r++)                 //ciclo che scorre le righe
{
   for (int c=0;c<array[r].length;c++,i++)       //ciclo che scorre le colonne (e aumenta la variabile che contiene i valori)
   {
      array[r][c] = i;                           //assegnazione valori
   }
}
for (int r=0;r<array.length;r++)
{
   for (int c=0;c<array[r].length;c++)
   {
      System.out.print(""+array[r][c]);          //stampa i valori a schermo
   }
   System.out.println();
}

edit: ecco ho raddoppiato inutilmente i cicli... vabbé