Discussioni simili cadono quasi inevitabilmente in flame perchè in fondo si parla di aria fritta
Nessuno può sapere con certezza cosa accadrà, Linux ha dei punti forza, in particolare la diversificazione delle installazioni e la velocità di chiusura delle falle. In futuro però è molto probabile che i virus "salgano di livello" e sfruttino framework cross-platform, o magari prodotti closed che causa forze maggiori vanno installati su linux (vedi flash), se poi ci mettiamo le falle intrinseche del web per quelle non c'è sistema che tenga, tutto è nelle mani dell'utente (a volte nemmeno).
Personalmente non credo che la diffusione porterà infezioni di massa su Linux nello stesso modo in cui le conosciamo su win. I tempi di correzione e update sono troppo veloci per permetterlo, così come la differenziazione delle distribuzioni. Probabilmente qualche virus si vedrà, vedremo quanto saranno dannosi. Mi preoccupano di più i livelli astratti, in particolare il web come dicevo prima, li si la differenziazione è sottile e madre natura insegna che una popolazione omogenea subisce stragi in caso di infezione.