[hexaae]

Chiariamo per tutti (non parlo a te nello specifico) una cosa riguardo alle "impostazioni" di indicizzazione:
le impostazioni che fai tramite il tasto destro su cartelle e file (avanzate... indicizza...) sono relative solo ai file già presenti all'interno.
Le impostazioni effettuate tramite il pannello di sistema "Opzioni di indicizzazione" (scrivi "indi" nel search di Vista) invece sono generali per un intero percorso e saranno indicizzati (o non indicizzati se lo imposti così) anche nuovi file o file modificati (riscritti) in quel percorso.

Perciò, se vuoi aggiungere un percorso per così dire dinamico, nel senso che lì dentro poi manipolerai i file, le impostazioni le devi fare da "Opzioni di indicizzazione".
Inoltre nel pannello "Opzioni di indicizzazione" se vai in opzioni avanzate troverai anche dove è possibile specificare i tipi di file da indicizzare.