mi sfugge qualcosa in questa discussione....
non capisco se il "controller" ti serve per accenderli/spegnerli o vuoi farci qualcos'altro...
la corrente dei neon non è quella che fornisce l'ali ma è proprio per questo che esistono le centraline (inverter) che invertono appunto tensione/corrente da continua ad alternata...
quindi per alimentare i neon usi i molex dell'ampli che danno i 12v...
solitamente quelli per pc hanno l'interruttore in una piastrina da mettere nella parte posteriore del case (dove ci sono gli slot per le schede aggiuntive)...
se la tua idea di "controller" è solo accendere/spegnere è sufficiente cambiare l'alloggiamento degli interruttori (metterli davanti), collegarli all'alimentatore e il gioco è fatto...
se invece vuoi un manettino che riduca di intensità la luce emessa, come ti diceva qualcuno più sopra... è più complicato di quanto si possa pensare...