[arara]

Originariamente inviato da Lorekon

essendo strutturato così
>nome sequenza
ACATGATGACGAT......etc....


tutti i nomi sono nella riga dispari, tutte le sequenze nella riga pari.

Potevi dirlo subito che aveva quella struttura, in questo caso è molto semplice da fare.
sto codice funziona, salvalo nel file split ed esegui:

python split InputFile X

che crea tanti file con ognuno X sequenze al suo interno.


(occhio alle tabulazioni!!! devono essere uguali)

import sys

inputFile = open(sys.argv[1], "r")
numeroFile=0
sequenzeCopiate=0
sequenzePerFile=int(sys.argv[2])*2

outputFile = open(str(numeroFile)+".txt", "w")

for linea in inputFile:
	if sequenzeCopiate == sequenzePerFile:
		outputFile.close()
		numeroFile = numeroFile+1
		outputFile = open(str(numeroFile)+".txt", "w")
		sequenzeCopiate=0
	outputFile.write(linea)
	sequenzeCopiate = sequenzeCopiate+1

inputFile.close()
outputFile.close()