eSATA è lo standard SATA utilizzato per connessioni esterne. Nessuna differenza di prestazioni tra SATA e eSATA.
Devi invece stare attento a quale standard SATA/eSATA è supportato, perchè ne esistono 2: SATA e SATA II (più correttamente indicato come SATA 3.0). Il SATA 3.0 ha un transfer rate doppio rispetto alla prima versione SATA, quindi molto più performante. E' compatibile con la versione precedente.
Parlando di box esterno, il massimo della versatilità e prestazioni lo trovi nel A.C.Ryan Alubox mod. ACR-HD50138, che puoi vedere
qua. Accetta internamente i vecchi HD standard IDE (PATA), come pure i nuovi SATA/SATA 3.0, e in uscita hai USB 2.0 e eSATA 3.0, quindi versatilissimo e performante. Confezione molto completa, con entrambi i cavi (USB e eSATA) di collegamento. Unici nei: un'estetica non da urlo (a mio giudizio), e bisogna stare attenti ad infilare nel modo giusto un cavetto, quando si richiude il box (basta un po' di attenzione). Costa pure poco (circa 35 euro), e tornerà utile per molti anni, vista la completa flessibilità di collegamenti

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Qua puoi leggere un test del box sopracitato.