Thunderbird è molto più avanti di OE, e lo puoi vedere già da quì:
http://www.mozilla-europe.org/it/pro...bird/features/
Il suo utilizzo, quindi, credo che possa portare soli benefici; in particolar modo in termini di sicurezza: aspetto che in un ufficio deve essere tenuto in grande considerazione.
Per la gestione degli archivi anche TB memorizza i messaggi in singoli file: per ogni account un file per la posta in arrivo, un altro per quella inviata ecc.
Magari per questa esigenza potresti affidarti a qualche estensione, come
http://nic-nac-project.de/~kaosmos/mboximport.html
Ciao