ShoShen

è probabile che le due cose non siano collegate...in quanto io non uso quasi mai emule, ma il ritardo nello spegnimento si verifica anche in assenza del processo che lo riguarda...(è solo un dettaglio e forse in parte una possibile spiegazione ma l unico segnale che da vista di aver capito il comando di spegnimento è la classica musichetta che avverte della chiusura della sessione...chi ha l abitudine di spegnere l audio potrebbe quindi ritrovarsi senza alcun segnale dell arresto del sistema)
per emule potresti provare magari a reinstallarlo nella sua classica collocazione c: programmi