ciao, questa cosa è piuttosto abituale, non tutti i programmi vengono disinstallati completamente (il fatto che abbia lasciato la cartella vuota è comune a molti programmi) se non ti crea qualche particolare problema ti conviene lasciare tutto
nella situazione in cui è ora...volendo puoi usare ccleaner per una pulizia superficiale, comunque non credo ti convenga andare a toccare il registro per problemi di questo tipo...la prossima volta puoi provare ad usare total uninstall (prima leggi bene le istruzioni) anche se credo che la cosa migliore sia lasciare fare all uninstaller integrato nei programmi che vuoi disinstallare ...o al massimo a windows
ciao