Allora con la scheda madre che hai intenzione di mettere non c'č nessun problema, avendo un normale dissipatore passivo sul chipset (quello in rame cn scritto sopra GIGABYTE x capirci):

Gigabyte GA-P35-DS3
Le heatpipes cmq sarebbero quei tubetti che collegano i dissipatori in rame su mosfet e chipset che si vedono nell'immagine qui sotto, un particolare del sistema di raffreddamento della Gigabyte GA-P35-DS4:

parcicolare della Gigabyte GA-P35-DS4