Il fatto che uno visiti la discussione, poi non sempre significa che sa rispondere.
Da quello che vedo tu hai una raid integrato nella scheda madre, giusto ?
Ora quei raid non sono dei veri raid, ma sono firmware (cioè software spiaccicato in una eprom) e di solito si chiamano fake raid.
Linux non è che vado molto d'accordo con questo tipo di raid.
Cosa può accadere ?
Installi Linux nel 3° disco e scegli di mettere il loader nell'MBR (nella traccia principale del disco di boot). Questo disco è in un fake raid.
Opzioni:
1) All'avvio di windows il sistema vede i dischi diversi e li allinea (son scettico);
2) Ti resta la schermata nera impallata perchè un disco è diverso dall'altro.
Se proprio fossi messo con le spalle al muro, sceglierei di installare il bootloader su floppy e fare boot da lì, in modo da non scrivere su due dischi in fake raid.
P.S:
A volte nelle Mobo Asus ci sono i drivers per il fake raid, ma in questo caso non servono. A meno che di fare come ti ho suggerito, installare i drivers, far risconoscere a Linux il raid e reinstallare il loader nell'MBR.