..1) lascia perdere
il raid 0 e fallo 1 o NULLA che è meglio
2) non crearti nulla, salvati solo i dati da qualche parte.
3) pialli tutto e se proprio vuoi installi Vista...
4) installato lui con i driver principali (senza software), ti fai la copia della partizione.
5) Nel primo HD dopo aver creato la copia con Acronis, e aver installato i software, defragghi e lo partizioni. dai 20 GB per ubuntu. Il secondo HD lo usi per archivio per tutti e due i sistemi (formattalo in fat 32)