Un programma gestione di partizione free è il gparted, che si può scaricare da:
http://gparted.sourceforge.net/index.php
E' utile la possibilità di scaricare direttamente la immagine iso del programma, da masterizzare per creare un cd di boot con cui operare sulle partizioni.
E' sempre meglio operare dall'esterno sulle partizioni da modificare, in modo da non avere file di sistema in ballo.
Ottimo secondo me è l'Acronis Disk Director Suite, che fa creare sempre un cd di boot; insieme all'Acronis true image home, la versione 10, compatibile con Vista, si può creare un cd di avvio contenente sia il programma di image che il programma gestione delle partizioni.
E' sempre meglio crearsi immagini di backup di una partizione prima di metterci mani.