volendo puoi formattare la partizione anche da windows con software esterni (es. partition magic), anche se un tempo conoscevo un'utility nascosta dentro windows che poteva farlo ma non la trovo più
. Comunque dal live cd, cliccando sull'icona install dovrebbe iniziare la procedura per l'installazione e se non erro fa anche scegliere il come formattarla
(scegli ext3)