Valuta la situazione prima di procedere: se lo schermo e' liscio/lucido non ci sono problemi, il peggio che possa succedere e' d'avere, alla fine, l'area interessata un po' piu' lucida del resto.
Se invece dovesse essere satinato (mi pare che a volte lo si trovi cosi', ma non ne sono certo) meglio lasciar perdere.
Comunque sia, se intervieni lavora con pazienza e delicatamente, senza premere troppo, e dai diverse passate usando ogni volta una piccola quantita' di pasta: forse non eliminerai il graffio completamente, ma dovresti comunque riuscire a ridurlo in maniera sensibile, dopodiche' gli attacchi su lo screen protector e via
.