[Dahlar]

si la tua scheda supporta nativamente il sata2, quindi non è un problema legato al sata....
l'unica cosa che mi viene da pensare è che il messaggio sia legato al fatto che il valore di "spin retry count" del tuo Hard Disk ha raggiunto il valore di soglia, mettendo così in allarme il sistema.
Purtroppo oggi il valore di soglia di questo parametro è messo troppo alto, considerato che solitamente parte da 100, a scendere al livello di 97 bastano 3 tentativi falliti di avviare il disco per mettere in allarme il sistema.
Dovremmo scoprire perchè fatica ad avviarsi l'HD, per riportare la situazione alla normalità...
ultimamente sono successe cose strane, o hai aggiornato l'hardware, magari aggiungendo qualcosa?
Questo parametro può scendere quando l'alimentatore non eroga sufficiente corrente, e così quando all'avvio c'è il massimo assorbimento per l'inizializzazione di tutti i componenti non ricevendo sufficiente potenza deve riprovare diverse volte per avviare la rotazione dei piatti.
Che alimentatore hai? (potenza / marca)?