Il "grat-grat" di per se non è preoccupante, in quanto è il rumore che un po' tutti gli HD emettono normalmente in fase di scrittura e/o lettura dei dati.
Di solito è più accentuato sui dischi non deframmentati (in quanto la lettura e scrittura dei dati è più laboriosa) e su quelli in cui si fa un massiccio impiego del "file di scambio" (ovvero quella porzione di HD usata dal sistema operativo come memoria supplementare), cosa che avviene normalmente su PC "poco dotati" di RAM.
Certo che se un forte e prolungato "grat-grat" si associa con qualche blocco di sistema e/o qualche segnalazione di errore di lettura su disco, allora il discorso cambia. Ma non mi sembra il tuo caso.
Il fatto che senti grattare l'HD anche quando non stai usando direttamente il PC è anch'esso un fatto abbastanza normale, poiché esistono diverse applicazioni (antivirus, screen saver, ecc..) che si avviano ed accedono al disco indipendetemente dalle azioni dell'utente.
Magari, se vuoi sentirlo grattare di meno, fai una deframmentazione utilizzando l'apposita utility di sistema e poi, giusto se vuoi stare più tranquillo, puoi scaricare ed installare il programma HD Tune con cui fare un check-up completo del disco.
HD Tune lo trovi qui:
http://www.hdtune.com/