Io direi tanto rumore per nulla: pare che la maggiore motivazione per la mancata inclusione dei bindings gtk# e di mono, sia la paura di scontentare qualche altro fornitore (Sun?)... non mi sembra una motivazione molto intelligente.
Per quanto riguarda i brevetti l'unica cosa su cui MS potrebbe obiettare sono le re-implementazioni di ADO.net, di ASP.net e delle Windows.Form che potrebbero benissimo essere rimosse in un eventuale mono-LIGHT per Gnome (a quanto mi risulta, Banshee, F-Spot, IFolder, Beagle... non le utilizzerebbero comunque).
Non vedo quindi vere motivazioni tecniche ma soltanto antipatia per uno standard ECMA proposto da MS.