Non so se possa riguardare direttamente l'assegnazione delle lettere alle unità, ma come rimuovi il pen drive?
Usi la funzione di disattivazione o la tiri via così?
E soprattutto hai per caso attivato la funzione di buffer in lettura /scrittura delle unità rimovibili? Mi pare che l'opzione stia fra le proprietà delle periferiche rimovibili (solita icona "rimozione sicura dell'hardware")?
Te lo chiedo perchè un amico aveva un problema simile al tuo (l'assegnazione non corretta dell'unità gli succedeva in modo casuale) ed ha risolto eliminando la funzione di buffer dell'unità esterna sulla ram. Si trattava di un HD, ma credo che la logica di gestione sia la stessa.