quello che chiedi è impossibile. Il PDF non è un formato modificabile e quindi non è detto che quello che vuoi ottenere si possa fare sempre.
Il formato PDF è stato creato per permettere di visualizzare/stampare sempre allo stesso modo un documento su ambienti differenti ... per questo non garantisce la modificabilità dei suoi contenuti.
Detto questo io conosco questo programma:
http://pdftohtml.sourceforge.net/
Ciao
Davide