per il fatto del boot loader ti consiglio di installare prima windows e poi ubuntu perchè se tu facessi il contrario win andrebbe a sovrascrivere il boot loader di ubuntu facendoti perdere tutto....
poi...durante l'installazione ubuntu ha un tool per poter partizionare manualmente il disco...ma se non sei pratico di quello e sai usare partition magic ti basta fare un po di spazio nell'hard disk...spazio vuoto senza alcuna formattazione...poi durante l'installazione di ubuntu basta che tu indichi al tool di partizioni di partizionare automaticamente lo spazio libero...e il gioco è fatto...spero di essere stato chiaro
per il resto per il raid non ti so dire...inoltre ti dico che per la tua ati abilitare il 3d è un pò laborioso ma non impossibile...ciao !