Cmdlines.txt viene richiamato automaticamente, se presente nella cartella $oem$, a circa 12 minuti dalla fine del setup (se non ricordo male), esegue tutti i batch indicati sotto [COMMANDS] e presenti all'interno della stessa cartella.
Più precisamente dovrebbe avviarsi prima dell'eliminazione dei file temporanei da parte del setup.
E' quindi un file che non deve essere richiamato manualmente
Controlla che RunOnceEx.cmd, avviato appunto da cmdlines.txt, sia scritto correttamente (se la sintassi di apertura del file è errata, non si avvieranno neanche i comandi successivi).
Ciao