Sauron, brutta situazione...
Molti indizi portano agli hd...
Fai una prova con
Windiff, fai delle copie di file grandi (se puoi anche da 5GB), copiandoli contemporaneamente (sembra sia importante per saturare il dma) su diverse directory (anche 3-4 copie).
Se non ottieni tutti identical, disinstalla il firewall nvidia e rifai la prova.
Se continuano ad esserci differenze, fatti prestare un disco ide da un amico e fai le stesse prove.
Sono prove empiriche, io farei così...
