Io ebbi un problema simile, ho reinstallato win in un'altra CARTELLA alla buona solo per salvare files che mi servivano, poi ho formattato tutto e reinstallato come si deve. Però anche un'altra partizione è una soluzione, installi come si deve in una nuova partizione, recuperi i files mettendoli nella partizione nuova di win, formatti la partizione vecchia e se vuoi la unifichi. Così hai un sistema funzionante a dovere e recuperi i files cha ti premevano.
Due piccioni con una fava!