Se vuoi scoprire qual'è il problema, per prima cosa mi sembrerebbe più che ovvio e scontato togliere qualsiasi tipo di overclock, in modo da eliminare una delle possibilità...
Dopodichè ti consiglio di controllare il molex dell'hd, e di provare a metterci un molex appartenente ad una catena "vuota".
Inoltre guarda un po' la temperatura (in linea di massima se il disco non brucia al tatto è ok).
Intanto io mi farei un backup dei dati importanti (non si sa mai...).
Cmq dalla descrizione del rumore sembra che il disco smetta di girare, per poi riprendere... Per questo io penso ad un problema di alimentazione.
Per quanto riguarda i fix, l'nf3 li ha, c'è solo da vedere come sono impostati da bios
