quanto amo java! :P
torniamo a java -jar eclipse ... provato a lanciarlo dalla home?
java -jar /home/tuahome/percorso del file/eclipse.jar
http://anon.inf.tu-dresden.de/fragen/start_en.html (centra poco ma l'errore sembra quello)
oppure
/usr/java/j2sdk1.4.0/jre/bin/java -jar eclipse? ovviamente cambia il percorso di java in base alla JVM che hai installato ... dopo questo credo di aver esaurito le mie capacitā su java :P