Sostanzialmente dipende dal codec che usi: in un'avi puoi muxare il divx o lo xvid perchč rispetti gli standard.
L'mkv generalmente viene usato con il codec h264/AVC molto pių efficiente e che quindi si adatta meglio ai flussi ad alta risoluzione.
Oltre il supporto di menų, capitoli ecc, come un dvd video.
Anticipato, chiedo scusa